BALDR SKY ZERO 2

彼が目覚めた時、そこは仮想の戦場だった。
記憶を失っていた彼は、悪名高き傭兵部隊 『フェンリル』 の分隊、『スコール』 に入隊し、エドワードという名前を与えられる。
仲間たちと共に任務をこなす中で、エドは州政府軍に追われていた少女・マレル と知り合い、これを保護する。
エドによって保護されたマレルのスコール入隊が決まってから数日。
誰かと組んで仕事をしようと考えていたエドに、ただ一人残っていたマレルが自分が組みたいと手を上げる。
記憶喪失という素性の知れない新入り二人が組むのはマズイだろうと考えるエドだったが、隊長のグッドマンは面白がってそれを許可する。
現実世界（リアル）の身体の所在が不明な “電子体幽霊（ワイアードゴースト）” であるマレルが人とのふれあいを持てるよう、仮想を訪れる機会を増やしてやるエド。
遠慮しながらも喜ぶマレルに、エドはこういうのも悪くないと思う。
そんなある日、マレルと組んでの任務中、ピンチに陥ったケイの救援に向かった先で、反応は電子体だが外観はシュミクラムという化け物のような異様な存在、賞金首（マッドドガー） 第三位・ラサーヤナ と遭遇する。
交戦の末、ラサーヤナに捕食されそうになったエドだが、なんとか事なきを得る。
状況を考えると、ラサーヤナはエドやマレルのことを知っているかのようだった。　ラサーヤナとは何者なのか？　エドやマレルとの関係は？
そして、今は何も分からないマレルの存在は、明らかになるのだろうか――